在美國，對航空運輸企業進行分類的傳統方法是按照貨代公司的任務分類，分為干線（trunklines）貨代公司、地方貨代公司（localservicecarriers）、全貨運貨代公司（allcargocarriers）、包機貨代公司（chartercarriers）等。而新的貨代公司分類方法則僅僅根據貨代公司的收入規模來進行分類，主要便于運輸部公布貨代公司數據。
美國運輸部使用的貨代公司分類術語可能會引起誤解，因為“國家貨代公司”并不一定要提供全國范圍的航空運輸服務，“地區貨代公司”也不必將其服務限制在某一地區之內。在美國，放松管制以來，通勤貨代公司的運輸量及其對社會的重要性迅猛增長，已經成為了向骨干貨代公司輸送客源、貨源的重要支線貨代公司，而非定期空中的士通常是根據需要使用很小的飛機提供包機服務。有客運權的貨代公司同時擁有貨運權，但也可以只申請國內全貨運貨代公司資格證書。需要強調的是，雖然上面提到了許多各種類型的貨代公司，但航空運輸業一直以來都是被幾家巨型貨代公司所壟斷。在美國城市間的旅客公共交通運輸中，航空運輸已占絕對優勢。
在中國，由于市場準入的限制，貨代公司一直以來都是國有企業，直屬民航總局領導，與航空發達國家相比規模很小。到20世紀80年代末90年代初，由于鼓勵地方政府興辦航空運輸企業，出現了所謂的地方貨代公司，民航運輸企業開始劃分為民航直屬貨代公司和地方貨代公司。到2002年，民航新一輪體制改革，與民航總局脫鉤；同時放寬了民營資本進入航空運輸市場的限制，民營貨代公司開始建立并投入運營。我國的貨代公司開始劃分為國務院直屬的三大航空集團公司、地方貨代公司和民營貨代公司。由于對公司普遍實行股份制改造，海航、南航、國航等公司相繼上市，各類貨代公司的資產構成也開始呈現多元化的發展。我國的民航運輸市場目前主要還是被三大航空集團公司和一些規模較大的地方貨代公司所壟斷。
從貨代公司的規模上看，我國現有的貨代公司中三大航空集團公司是在原有的老牌民航直屬貨代公司基礎上組建的，相比而言規模最大；地方貨代公司經過十幾年的發展，也形成了一定規模；新成立的民營貨代公司剛剛起步，規模還很小，一般只有幾架飛機，但也是我國航空運輸市場上一支不可忽視的新生力量。我國中長距離的民航運輸市場發展迅速，短途支線航空運輸開始起步，很多貨代公司已涉足支線業務，但還沒有出現專門經營支線的貨代公司。我國的貨代公司大多屬于綜合性貨代公司，客運、貨運，干線、支線業務全方位開展。
但近年來，隨著國外全貨運貨代公司進入我國開展業務（如美國聯合包裹（UPS）和聯邦快遞（FedExpress）在我國上海和廣州建立運營基地），合資成立的全貨運貨代公司開始運營（如漢莎貨代公司參股的翡翠國際貨運航空有限責任公司，揚子江快運航空有限公司），以及國內新成立的全貨運貨代公司的出現（如中國貨運航空有限公司、國航貨運分公司），使得我國的航空運輸業結構變得更為復雜。
