在進行航空運輸網絡決策時，航空公司內部影響因素也很重要，不可忽視。下面分 析以下主要影響因素。
1)航空公司的戰略目標和商務模式各航空公司基本都制定了戰略目標，明確了航空公司運輸主業的商務模式、市場定位和顧客群體。例如，眾所周知的美國西南航空公司將自己定位于低成本商務模式的地區航空公司，其航空運輸結構基本以城市對為主，后來逐步發展成現在的蛛網式網絡，但不搞樞紐輪輻系統。
2航空公司現有航空運輸網絡 國內現有航空運輸基本上是城市對的，對于客流量大的航空運輸，采用城市對航空運輸可以減少旅客的旅行時間，降低航空公司的運輸組織難度。但對于運輸需求少的航空運輸， 則由于航班頻率太低，給旅客出行帶來不便，同時航空公司也因為成本太高而無法盈利。通過改造航空運輸網絡結構可以改變這種狀況。
3)航空公司市場開發能力市場開發能力取決于航空公司高層領導的重視程度、市場主管部門的開發能力以及公司內部各部門的協同水平；市場開發能力將直接決定航空運輸網絡的覆蓋范圍。從航空公司發展的歷史來看，一支素質高、戰斗力強的市場開發隊伍將設計出優質的航空運輸網絡。
4)航空公司運行管理能力不同的航空運輸網絡需要采取不同的飛機運行模式，這意味著航空公司應掌握不同的運行管理技術，具備不同的運行管理能力。當航空公司擬采用新的航空運輸網絡結構時，首先要學習和掌握新結構航空運輸網絡的運行管理技術，并能確保運行模式成功轉型。否則，可能會停留在概念操作的層面上，穿著新鞋走老路。
