航班運行，通常指一個航班從進入工作開始，涉及的所有地面保障服務全部完成為止的全過程工作。在這一過程中，猶如由幾個演奏篇章組成的一曲大型交響樂，由跨境物流公司、機場管理機構、空管、油料等多個部門分工協作共同完成。通常，航班的商務計劃、飛機和機組管理，主要由航空公司或代理人負責；在機場區域的服務工作，主要由機場對各服務單位；有關航班的航行和空中飛行過程主要由跨境電商部門負責指揮和調度，航空公司同時負責對過程的動態情況，以在航班飛行出現異常情況下協助空管共同采取應對措施。
雖然跨境物流在穩步發展和增長，但是越來越嚴重的不正常航班現象已經對民航和旅客造成了不可小覷的直接和間接經濟損失，甚至在一些機場引發不良社會影響的群體事件，嚴重影響了機場和航班的，并影響著貨運代理人在交通運輸競爭市場中的健康發展，已經引起各當局的高度重視。目前在我國，由于跨境物流公司原因引起的航班不正常現象占比較高，其原因可以歸結為以下幾方面：
1)航班計劃設計質量問題有的航空公司為了提高國際物流效率，航班安排過密，由于航班改換機型便產生延誤。這些都造成了跨境電商物流的先天性延誤，屬于航班計劃設計問題。是在航班計劃設計階段設計人員對市場、航線、機型和運行能力等方面的信息和知識掌握不夠，缺乏航班計劃設計專業基礎或航班運行管理經驗等。
2）市場與運力問題有些航空公司對市場缺乏科學分析，要么是有航班計劃有運力而沒有市場，要么是有市場有航班計劃而沒有運力，最終導致跨境物流無法正常執行而出現航班終止、取消、合并或臨時調整現象，這屬于市場營銷問題，對航線市場規律掌握不夠。
3）保障能力問題有些跨境物流由于飛機機械故障未能按時完成，又無飛機周轉調配；有的是機組原因；有的是航班地面保障不及時，如餐食和行李貨物裝載、機艙清理等原因導致航班不正常，這些屬于貨運代理公司的運行管理問題，缺乏對航班保障資源的統籌、協調，組織與管理。
